低保房的管理主要 归民政部门负责。无论是农村还是城市的低保户，其住房或收入明显低于当地低保标准的居（村）民，其住房或困难补助均由民政部门管理。
具体到农村低保房，它属于当地民政所，由县民政局对口管理。城市低保则在三条保障线制度基础上实施，而农村低保则依据农村低保标准和家庭收入水平进行审批。
此外，政府出资给低保户盖的房子，其归属权通常属于政府。低保户只有居住的资格，没有交易转让的权利。这种政策属于对他们的补助，房子只是让他们赞助，而不是给了他们。在特定条件下，如居住一定年限后，如果低保户能够有一定的积蓄，并给政府一些钱，房子可能会以最低的价格卖给他们，这时房子才属于他们自己。
综上所述，低保房的管理和归属权主要归民政部门，具体到农村则由当地民政所和县民政局管理，而政府出资建设的低保房则归政府所有，低保户仅有居住权。
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