违法干股的处理方式主要取决于干股的性质、持有者的行为及其严重程度。以下是可能的处理方式：
刑事责任
如果干股股东的违法行为符合受贿罪等罪名的构成要件，则要受到刑法的制裁。具体处罚根据受贿数额和其他情节轻重，可判处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；数额巨大或有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金或者没收财产；数额特别巨大或有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或没收财产。
党纪、政纪处分
对于违反党纪、政纪的干股股东，应当受到相应的党纪、政纪处分。
法律责任
如果干股持有者滥用权利，给公司或其他股东造成损失，需要依法承担赔偿责任。
如果干股持有者未实际缴纳出资，需要在不实的出资范围内承担责任，包括向公司补足出资并承担损失赔偿责任，以及向已按期足额缴纳出资的股东承担违约责任。
行政责任
对于证券从业人员违法持有股票的行为，例如北京证监局对国都证券原总经理杨江权的处罚，可能会采取警示函、罚款等措施。
股东资格处理
对于因违法交易而产生的干股股东，不会保护其股东资格，同时也要追究其相应的法律责任。
综上所述，违法干股的处理方式包括刑事责任、党纪政纪处分、法律责任、行政责任以及股东资格的取消。具体处理方式需要根据案件的具体情况和相关法律法规来确定。建议违法干股股东积极配合调查和司法程序，以减轻其法律后果。
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