在南通起诉离婚，应向 被告住所地或经常居住地的人民法院提起诉讼。具体来说：
被告住所地法院 ：一般情况下，离婚案件应由被告住所地的人民法院管辖。经常居住地法院：
若被告的住所地与其经常居住地不一致，则应向被告经常居住地的人民法院提起诉讼。
特殊情况
如果双方当事人均不在江苏居住，离婚诉讼的管辖法院可能较为复杂，需根据具体情况确定。
若被告下落不明，原告可以选择在其最后居住地的法院起诉。
综上所述，起诉离婚时，若知道对方的居住地，则向被告所在地的法院提起诉讼；若不知道对方居住地或对方下落不明，则向原告所在地的法院提起诉讼。准备起诉时，需准备相关证据材料，如身份证、户口簿、结婚证等，并按照法院要求提交起诉状及副本。
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