运输企业在运营过程中需要缴纳的主要税费包括：
增值税：
根据提供的服务类型和销售额，按照一定的税率征收。
城市维护建设税：
通常基于增值税的一定比例征收。
教育费附加：
基于增值税的一定比例征收。
地方教育费附加：
基于增值税的一定比例征收。
企业所得税：
根据企业年度利润的一定比例征收。
个人所得税：
对员工工资薪金所得征收。
印花税：
根据签订的合同金额的一定比率征收。
房产税：
对自有房产征收。
城镇土地使用税：
对使用土地的单位和个人征收。
车船使用税：
对拥有车船的单位和个人征收。
请注意，税率可能会根据政策调整而有所变化，具体情况应以最新的税法规定为准。
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